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允英出品|NGS-HRD正式上线,双重验证,全面评估卵巢癌等患者PARP抑制剂敏感性!
发布时间: 2022-4-15 10:57:15

允英NGS-HRD

✓  允英NGS-HRD 通过同源重组通路基因检测与HRD Score联合检测,双维度相互验证。

  通过检测杂合性缺失(LOH)、端粒等位基因失衡(TAI)及大片段移位(LST)综合得分来评估HRD状态,同时还提供包括BRCA1/2等HRR相关基因的检测结果,全面评估卵巢癌等患者对PARP抑制剂的敏感性。


什么是HRD?

  同源重组修复缺陷(HRD,homologous recombination deficiency)会产生特定的,可量化,稳定的基因组改变,是一种基因组不稳定的状态,其中包含可被鉴定的基因突变、插入/缺失,以及染色体结构异常,基因拷贝数变异等。

  发生HRD的肿瘤细胞不能准确地修复DNA,转而依赖其他易错的途径来修复DNA, 这一缺陷导致基因组疤痕

  常见的基因组疤痕有三种类型:基因组杂合性丢失(LOH, loss of heterozygosity)、端粒等位基因失衡(TAI,telomeric allelic imbalance)和大片段迁移(LST,large-scale state transitions)。通过计算LOH+TAI+LST的分值,进而评估HRD状态。



HRR和HRD之间的关系?

  同源重组修复(HRR,homology dependent recombination repair)是一种高保真的修复方式,该过程是一条复杂的信号通路,需要诸多基因参与。BRCA1/2、PALB2、BARD1、BRIP1、RAD51B、RAD51C、RAD51D、ATM、FAAP20、CHEK2、FAN1、FANCE、FANCM等基因统一被称为HRR相关基因

  HRR通路基因突变等因素可导致HRD的发生

  发生HRD的肿瘤细胞由于不能准确的修复DNA损伤依赖其他易错的途径来修复DNA, 这一缺陷导致基因组疤痕。

  即HRR相关基因突变检测是从导致HRD的“因”来检测HRD,基因组疤痕分析则是从HRD引起的“果”来检测HRD。

为什么要检测HRD?

  PROfound等多项研究数据显示HRR基因改变可以提示卵巢癌、乳腺癌、前列腺癌、胰腺癌等患者对PARP抑制剂药物治疗的敏感性。

1. 卵巢癌

  HRD检测可以使卵巢癌患者PARP抑制剂敏感人群从占20%左右的BRCA突变人群扩大到占50%左右的HRD阳性人群。

  PAOLA-1研究显示,在HRD阳性组(包括BRCA突变的患者)的卵巢癌患者中,奥拉帕利联合贝伐珠单抗一线维持治疗组的mPFS为37.2个月,贝伐珠单抗单药治疗组mPFS为17.7个月,同时联合治疗组疾病进展和死亡的风险降低67%

  国内外多个指南建议卵巢癌患者检测HRD,指导奥拉帕利等PARP抑制剂治疗


2、乳腺癌

  HRD阳性乳腺癌多见于三阴性乳腺癌,BRCA1/2 基因胚系突变是导致乳腺癌 HRD最常见的原因,PALB2的生殖系突变以及BRCA1和RAD51的启动子甲基化等也会引起HRD。

  TBCRC 048研究显示PALB2胚系突变(gPALB2,ORR=82%)和sBRCA(ORR=50%)突变的患者中观察到PARP抑制剂明确的应答。

3、前列腺癌

  美国FDA已批准奥拉帕利用于治疗经新型内分泌治疗后进展且携带HRR突变的mCRPC患者(ATM、BRCA1、BRCA2、BARD1、BRIP1、CDK12、CHEK1、CHEK2、FANCL、PALB2、RAD51B、RAD51C、RAD51D、RAD54L);批准卢卡帕利治疗经新型内分泌治疗和多西他赛化疗后进展且携带BRCA突变的mCRPC患者。

  PROfonnd研究显示奥拉帕利显著改善携带HRR基因突变转移性前列腺癌患者无进展生存期和总生存期。

4、胰腺癌

  美国FDA批准PARP抑制剂奥拉帕利(olaparib)作为接受含铂一线化疗方案至少16周病情仍未进展、携带有害或疑似有害胚系BRCA突变(gBRCAm)的转移性胰腺癌成人患者的一线维持治疗。

  既往研究发现,约4-7%的胰腺癌患者携带胚系BRCA1/2突变,这些患者对铂类药物尤其敏感。

  POLO研究结果显示奥拉帕利组相比安慰剂组,中位PFS显著延长(7.4个月 vs 3.8个月,HR=0.53,P=0.0038),疾病进展风险降低47%。


允英HRD检测项目

允英NGS-HRD 通过同源重组通路基因检测与HRD Score联合检测,双维度相互验证。

  通过检测杂合性缺失(LOH)、端粒等位基因失衡(TAI)及大片段移位(LST)综合得分来评估HRD状态,同时还提供包括BRCA1/2等HRR相关基因的检测结果,全面评估卵巢癌等患者对PARP抑制剂的敏感性。

HRD状态判定:

  允英NGS-HRD项目采用国际HRD评判标准,结合通过生物信息学权威算法,从LOH、TAI和LST三个方面分析样本DNA同源重组修复缺陷(HRD)情况,统计HRD评分,同时结合BRCA1/2基因的突变情况,最终如果HRD评分大于等于42或者检出BRCA1/2突变,即认定该患者为HRD阳性,反之则为阴性。


允英NGS-HRD 样本类型

肿瘤组织(新鲜手术组织/穿刺组织/FFPE肿瘤组织石蜡切片[保存时间一年以内])

Ø 精准指导卵巢癌/乳腺癌/前列腺癌/胰腺癌/PARP抑制剂及铂类用药

肿瘤组织(新鲜手术组织/穿刺组织/FFPE肿瘤组织石蜡切片[保存时间一年以内])+ 全血(对照血)
Ø 精准指导卵巢癌/乳腺癌/前列腺癌/胰腺癌/PARP抑制剂及铂类用药
Ø 提供胚系遗传信息

适用人群

·卵巢癌、胰腺癌、前列腺癌、乳腺癌患者;

·既往检测BRCA1/2检测阴性,寻求PARP抑制剂获益的患者。

检测优势

参考文献:
[1] 中国抗癌协会肿瘤标志专业委员会遗传性肿瘤标志物协作组,中华医学会病理学分会分子病理学组,辇伟奇,等.同源重组修复缺陷临床检测与应用专家共识(2021版)[J].中国癌症防治杂志 2021年13卷4期, 329-338页, 2021.
[2] Lynparza Phase III PAOLA-1 trial met primary endpoint as 1st-line maintenance treatment with bevacizumab for advanced ovarian cancer [press release]. Kenilworth, NJ: AstraZeneca and MSD Inc; August 14, 2019.
[3] 610O - Final overall survival (OS) analysis of PROfound: Olaparib vs physician’s choice of enzalutamide or abiraterone in patients (pts) with metastatic castration-resistant prostate cancer (mCRPC) and homologous recombination repair (HRR) gene alterations